Na Trgu bana Jelačića 20.000 mladih vernika pozdravljali su papu Benedikta XVI i uzvikivali "Papa, mi te volimo", "Benedikte", mahali zastavama Hrvatske i Vatikana. Pre toga, u okviru svoje posete Hrvatskoj, za poglavara Rimokatoličke crkve upriličen je susret na kom je prisustvovalo oko 700 predstavnika javnog i verskog života. Sutradan, 5. juna, papa je održao misu na Hipodromu u Zagrebu. Misi je prisustvovalo oko 300.000 vernika, što je manje od očekivanog. Prethodni papa Jovan Pavle II tri puta je posetio susednu Hrvatsku gde se skoro 88 odsto stanovnika, prema poslednjem popisu, deklarišu kao katolici. Ovo je prva poseta sadašnjeg rimokatoličkog poglavara.

Boravak pape Benedikta XVI praćen je visokim merama bezbednosti, a u organizaciji posete učestvovalo je 10.000 ljudi. Poglavar rimokatoličke crkve govorio je o porodici, braku, veri, Hrvatskoj u Evropi, abortusu. "Moramo, nažalost, ustanoviti, da se, posebno u Europi, širi sekularizacija koja Boga života gura na rub te donosi rastuću razjedinjenost obitelji… Ljubav se svodi na sentimentalni osjećaj i zadovoljavanje nagonskih poriva, bez nastojanja da se stvore trajne veze međusobne pripadnosti…", reči su pape Benedikta XVI.

Dobrodošlicu je papi prvi poželeo hrvatski predsednik Ivo Josipović, a zatim i predsednica vlade Jadranka Kosor. Predsednik Josipović je kazao da je Hrvatska počašćena njegovim dolaskom i to baš, kako je naglasio, u trenutku kada je na korak od Evropske unije, pred ulazak u svet kojem oduvek pripada.

Kako prenose hrvatski mediji, poglavar Vatikana je prilikom dolaska u susednu državu u avionu razgovarao sa novinarima. Povodom Alojzija Stepinca, koga je Katolička crkva proglasila blaženim, a čiji lik i delo predstavljaju veliku kočnicu u odnosima između Srpske pravoslavne crkve i Katoličke crkve, rekao je: "Kardinal Stepinac bio je veliki pastir i veliki hrišćanin, a i čovek izrazitog humanizma. Rekao bih da je sudbina kardinala Stepinca bila da živi u dve suprotstavljene i antihumanističke diktature: prvo u ustaškom režimu, koji je tobože ostvarivao san autonomije i samostalnosti, ali je u stvarnosti ta autonomija bila laž jer ju je Hitler instrumentalizovao za svoje ciljeve. Kardinal Stepinac je to veoma dobro shvatio i branio je istinski humanizam protiv tog režima, braneći Srbe, Jevreje i Rome." Tokom posete, obišao je i njegov grob. Pojedini strani mediji i ovdašnja javnost osudili su veličanje "kontroverznog kardinala iz Drugog svetskog rata", kako je Alojzija Stepinca nazvao britanski Bi-Bi-Si.

Oko 20 časova, u nedelju, papa Benedikt XVI je avionom krenuo za Rim. Jak pljusak i grmljavina na zagrebačkom aerodromu onemogućili su ga da održi oproštajni govor.